صرح الشيخ سالم عبد الجليل وقال تصريحات نحو الدين المسيحي والمسحيين، حيث صرح سالم عبد الجليل نحو الديانة المسيحية بأنها عقيدة فاسدة، وقد قام المحامى نجيب جبرائيل برفع قضية ضده بتهمة ازدراء الأديان، بجانب عملية تهديد للوحدة الوطنية كما صرح، ومن جانب أخر فقد ناقش مجمع البحوث الإسلامية من خلال جلسة يوم الخميس اليوم الموافق 11 مايو 2017 داخل مشيخة الأزهر حول تصريحات الدكتور سالم عبد الجليل، بخصوص الديانة المسيحية والمسيحيين.

وقد اكد مجمع البحوث الإسلامية حول ما تم من إقوال من خلال الدكتور سالم عبد الجليل، ما هو إلا رأيه الشخصي ولا علاقة للأزهر الشريف به وإن الأزهر الشريف لا يُكفر الناس وغير مختص لأي هيئة من هيئاته التي تقوم بعلم التفسير إن تتحدث باسمه، وأن الشيخ الدكتور سالم عبد الجليل لا يمثل الأزهر الشريف، وإن من يقوم بتمثيل الأزهر الشريف فقط هو شيخ الأزهر، بجانب ما يتم نشره من قرارات تصدر من هيئة كبار العلماء مجتمعة، وأيضاً من مجمع البحوث الإسلامية أو دار الإفتاء المصرية.

أستكمل مجمع البحوث الإسلامية تصريحاته بإن الأزهر الشريف لا ينشر إلا صفات البر والحب والإخاء مع الغير من أصحاب الديانة المسيحية، كما أمرنا القران الكريم بذلك وتوصيات رسول الله سيدنا محمد، وإنه يجب للمتحدثين بخصوص الدين أن لا يكونوا فخاخ يتم استغلالها من أصحاب الفتن المختلفة، ومن يريدون تخريب ترابط المجتمع المصري، وان يلتزم الجميع بأخلاق الإسلام والمبادىء والوابلون والأحكام الموجودة فيه.